immaginabiotech iUDI Plate LACEseq說明書
iUDI Plate LACEseq unique dual index Plate包含用于擴增indexed Illumina®兼容NGS文庫的*雙索引PCR引物。這些引物可用于需要TruSeq的LACEseq套件中™可共用的
索引引物。
iUDI Plate LACEseq包含索引PCR引物,并提供多達24對*的雙索引,用于復用多達24個樣本。索引的PCR引物預先分配在96孔PCR板中。每個雙指數都有足夠的量,可用于5-10個反應。
所有指標均已通過功能驗證,可與使用雙通道或四通道化學進行堿基調用的Illumina測序系統協同工作。
一般注意事項
A、 最佳做法
•不建議iUDI板LACEseq索引板經歷五次以上的凍融循環。
•使用前,取下蓋子。在室溫下解凍10分鐘,然后將盤子旋轉至試管底部的顆粒內容物。確保板在打開前沒有可見的冷凝水。在使用過程中,請將盤子放在冰上。
•準備索引PCR時,使用移液管j端刺穿板的密封,然后直接移取所需體積的索引引物。始終為每口井使用單獨的吸管頭,以避免指數交叉污染。使用后再次密封板,以避免溢出。
B、 產品兼容性
iUDI板帶
iUDI板LACEseq板設計用于LACEseqTM和PAGExtTM IMMAGINA產品(目錄號#LS-001和目錄號#KGE-002)。請參閱LACEseqTM和PAGExtTM試劑盒特定用戶手冊,了解使用iUDI板中提供的索引PCR引物的說明
LACEseq板。引物對未甲基化。
C、 多路復用和解擴
重要的是選擇適當且符合Illumina推薦兼容性要求的單一索引。LACEseq iUDI引物對的指數以四對為一組進行顏色平衡
(1-4, 5-8, 9-12,13-16). 每組四個索引都是*顏色平衡的,可以合并排序。可以復用的樣本數少于四個,但在合并之前要驗證顏色平衡。不要跨行共享庫。
我們不建議將Imagina庫與其他供應商的庫在同一個序列通道中進行復用。雖然原則上這是可能的,但可能需要對索引組合、庫池條件和加載量進行特定的優化。對包含不同通道共享的不同庫類型的復雜池進行排序可能會對排序運行度量、讀取質量、讀取輸出和/或解復用性能產生不可預測的影響。Imagina對在同一通道(或運行)中與外部庫類型組合排序的Imagina庫的性能更改不承擔任何責任。