IL28B RealFast™檢測 | 7-200 7-203 |
一。預期用途
IL28B RealFast™檢測是一種快速、準確的實時PCR檢測方法,用于檢測
人干擾素lambda 4(ifnl4)基因/假基因,位于白細胞介素28b(il28b)基因上游。遺傳
有助于預測丙型肝炎病毒(HCV)感染患者的治療反應,這些患者正在考慮接受聚乙二醇干擾素/利巴韋林(PEGIFN/RBV)治療。有利tt等位基因的純合攜帶者傾向于高達3倍
持續病毒學應答(SVR)比∏G等位基因攜帶者。在人類DNA提取液中,定性分析鑒別出
可能與高(TT/TT)或低(TT/△G和△G/△G)治療相關的IFNL4 TT>ΔG基因型——誘導或自發清除HCV。
參考序列:HGVS:NG U 042193.1:G.1457 U 1458;Delaainsc;NCBI DBSNP:RS368234815。
2.介紹
慢性丙型肝炎病毒感染影響了大約3%的世界人口,是肝硬化、肝癌和肝移植的主要原因。
推薦的pegifn/rbv標準療法的成功與否取決于病毒和宿主因素?;颊吒腥静焕?/p>
1型或4型hcv的svr低于2型或3型hcv感染者。影響治療反應的宿主因素包括年齡、性別
影響抗病毒活性的種族和遺傳多態性。ifnl4 rs368234815 t t>.-g變體與rs12979860 c>t緊密相關,
長期治療成功的標志。幾項研究表明rs368234815是il28b的功能變異
mrna調節,與rs12979860相比,作為svr和hcv清除的更好預測因子,尤其是在非洲患者中
祖先。IFNL4基因型TT/TT有利于HCV患者自發和治療誘導的病毒清除,主要是在那些
感染1型或4型。
三。套件內含物100/32 RXN
realfast™2x基因分型混合物1瓶白色瓶蓋1000/320微升
IL28B分析混合物1瓶紫色瓶蓋550/550微升
IL28B TT/TT對照品1瓶綠蓋75/75微升
IL28B∏g/∏g-對照品1瓶紅蓋75/75微升
該試劑盒包含終體積為20微升的100/32反應試劑
每一個。
realfast™2x基因分型混合物包括hotstart taq
優化緩沖體系中的dna聚合酶和dntps。IL28B分析混合物由IFNL4基因特異性引物和兩個等位基因特異性雙標記水解探針組成。
試劑盒中提供了代表il28b tt/tt和∏g/∏g基因型的對照品。
四。儲存和穩定性
IL28B RealFast™分析用冷卻塊裝運。到達后,將試劑盒保存在-20°C?;蛘?,將試劑盒保存在2到8°C,以便在
一個月。該試劑盒可承受20次冷凍/解凍循環,且無活性損失。避免長時間暴露在強光下。如果存儲正確,
試劑盒將保持完整的活性,直到標簽上標明的有效期為止。5個。產品描述
5.1。試驗原理
該試驗基于熒光5'核酸酶分析,也稱為Taqman®分析。每個反應都包含一對基因特異性引物
它放大了ifnl4基因的110bp片段,以及兩個雙標記的等位基因特異性水解探針
擴增片段的序列。5’熒光探針和3’-猝滅染料在完整探針上的接近阻止了記者
從熒光中。在聚合酶鏈反應的延伸階段,taq dna聚合酶的5'-3'外切酶活性能裂解5'-熒光
雜交探測器的記者。熒光團與猝滅染料的物理分離實時產生熒光信號,熒光信號與累積的pcr產物成正比。
在純合tt/tt樣本中,hex標記的tt探針與基因片段的互補鏈雜交。強壯的
在hex通道(556nm)中檢測到熒光信號,在fam通道(520nm)中沒有或僅檢測到基線信號。反之亦然,在
純合子∏g/∏g樣本fam標記的∏g探針與基因片段結合。fam中檢測到強熒光信號
在十六進制通道中沒有或只有一個基線信號。在雜合子樣本中(TT/△G),兩個探針都與擴增子結合,并且
在兩個通道中生成中間信號。
5.2。實時PCR儀器兼容性
IL28B RealFast™分析經驗證可與AB 7500快速儀器一起使用。
該試劑盒與能夠記錄FAM和HEX熒光的各種通用實時PCR儀器兼容:
使用AB StepOne™時,將被動參考染料設置為“Rox”!提供的套件不含ROX。用于需要高rox的實時pcr儀器,用于數據的標準化(例如
Biosystems®儀器:StepOne™,7300,7900/7900ht),在2X基因分型混合物中添加終濃度為1μm的RoX。
5.3條。分析性能規范
il28b realfast™分析和檢測高度連鎖rs12979860 c>t多態性的參考試劑盒顯示99,4%
84份樣品基因分型結果的一致性。
在168個等位基因中,IL28B realfast™分析鑒定出113個有利TT和55個不利∏G等位基因,而參考試劑盒鑒定出
114個有利c等位基因和54個不利t等位基因。對一個不一致的樣本進行測序后發現,存在∏g等位基因,但不存在
與一條染色體上的rs12979860 t等位基因相關。
IL28B RealFast™檢測的敏感性和特異性分別顯示真陽性和真陰性。
檢測限:0.2ng基因組dna(每次反應)。建議DNA濃度:2至20 ng/μL基因組DNA。6.需要但未提供的材料
帶FAM(520 nm)和HEX(556 nm)過濾器的實時PCR儀器,儀器兼容的反應容器,一次性無粉末
手套、渦流器、2.0毫升試管的微型離心機、試管架、一套校準的微量移液管(0.5–1000微升)、帶氣溶膠屏障的無菌針頭
過濾器,分子級水,DNA提取系統,冷凍柜,生物危害廢物容器。