biochain K5011610說明書
cfPure® Cell Free DNA Extraction Kit (100 ml)
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K5011610
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BioChain的cfPure®無細胞DNA提取試劑盒旨在快速有效地純化循環中的無細胞DNA(cfDNA)。該系統利用二氧化硅涂層的順磁性顆粒來凈化無細胞[…]
描述
BioChain的cfPure®無細胞DNA提取試劑盒旨在快速有效地純化循環中的無細胞DNA(cfDNA)。該系統利用涂有二氧化硅的順磁性顆粒來純化無細胞DNA,其血清或血漿的濃度從不到1 mL到大于10 mL。開發緩沖液以確保有效回收100 bp – 500 bp DNA片段,以一定程度地回收無細胞DNA?;厥盏腄NA適用于廣泛的下游應用,例如亞硫酸氫鹽測序,NGS和qPCR。
從血漿,血清和尿液中提取高質量的無細胞DNA,用于下一代測序(NGS),亞硫酸氫鹽測序,PCR,qPCR,ddPCR和其他苛刻的應用
•用途廣泛: 從<1mL到> 10mL的血清或血漿中提取–在單管或24至96孔板中
•自動化友好: 在KingFisher™和液體處理儀器上,提取過程大約需要50分鐘
•省時: 手動提取協議耗時少于75分鐘
•具有成本效益: 從1毫升血漿中每次提取的*3美元(250毫升試劑盒的標價)
•洗脫體積: 15 µL至50 µL
cfPure®方案快速簡便,使用戶可以在一個小時或更短的時間內處理多個樣品,非常適合生物標志物篩選。BioChain開發了自己的二氧化硅涂層磁珠技術,該技術旨在在分離過程中有效回收低分子量無細胞DNA。除了易于執行和易于自動化之外,如果要純化少量等離子體,還可以使用較少的磁珠溶液,從而節省了資金。成功分析cfDNA的關鍵是確保有效純化較小的DNA片段(100-500 bp)。如圖1所示,cfPure®無細胞DNA提取試劑盒可有效回收這些重要的小片段。
Cfpure設計為可擴展的套件(圖2)。這意味著您可以僅使用cfDNA提取所需的珠子和試劑量。這也意味著每個試劑盒的提取次數取決于您要純化DNA的樣品量。例如,如果您使用的是1mL樣品,我們的100mL試劑盒(產品目錄號K5011610)多可以處理100個樣品,而我們的250mL試劑盒(產品目錄號K5011610)則可以處理250個樣品。如果您使用的是10mL樣品,那么我們的100mL試劑盒(目錄號K5011610)多可以處理10個樣品,而我們的250mL無細胞DNA提取試劑盒(目錄號K5011625)可以處理25個樣品。
與其他分離cfDNA的技術相比,磁珠具有許多優勢。珠子比玻璃纖維過濾器更有效地結合DNA,從而獲得更高,更一致的產量。此外,由于不使用過濾器和真空歧管,因此在提取過程中不會存在細胞微粒堵塞這些物品的風險。對于cfDNA研究中常用的富含蛋白質的大量樣品(例如血漿),此堵塞問題尤為重要。
cfPure®cfDNA提取試劑盒提取的cfDNA非常適合下游應用(例如NGS)。在第三方研究中,使用BioChain的cfPure®(B),競爭者的T(T)和競爭者的Q(基于列的Q)cfDNA提取試劑盒,從4個供體的10毫升人血漿中提取cfDNA。然后為每個樣品構建文庫,并進行全基因組測序。從數據分析來看,三種提取方法均未顯示出明顯的性能差異:插入片段大?。▓D3),作圖速率,全基因組覆蓋率,取代率和GC偏差(圖4)。
我們優化的基于磁珠的方案使用戶能夠擴展方案,以用于從100 µl到10 ml的任何樣品體積,并具有高度可重復的結果和的cfDNA回收率(表1和2)。
cfPure®無細胞DNA提取試劑盒適用于KingFisher™(圖5)和液體處理儀器。借助KingFisher™Flex和BioChain的cfPure®無細胞DNA提取試劑盒,可在50分鐘內提取多達96個1 ml樣品,或在一小時內提取24個5 ml樣品。