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pnabio PNA鉗夾套件

 更新時間:2018-09-05 點擊量:3308

PNA BIO INC致力于為基礎研究和應用領域的實驗室提供的研究產品和服務。

PNA Bio提供PNA(Peptide Nucleic Acid)產品,包括定制寡核苷酸,FISH探針,miRNA抑制劑,PNA鉗夾探針和Fmoc單體。HPLC純化后,它們與MS / MS數據一起提供> 95%的純度。PNA產品由Panagene制造。

PNA Bio還提供工程化核酸酶服務,包括CRISPR / Cas9核酸酶(RGEN)合成,驗證和Cas9蛋白以及敲除和敲入細胞系服務。

 

PNA Clamp Kits   PNA鉗夾套件

 

PNAClamp技術是基于PNA的PCR鉗制,其僅選擇性地擴增突變的靶DNA序列作為與主要野生型DNA序列的混合物中的次要部分。它充分利用了PNA探針的性質,其對其靶DNA具有強結合親和力和特異性,并且不被DNA聚合酶識別為引物。

PNAClamp突變檢測試劑盒可以使用來自手術組織或福爾馬林固定的石蠟包埋活組織檢查(FFPE)的DNA樣本。

PNAClamp突變檢測試劑盒與傳統方法相比具有許多優勢。

·  在短時間內檢測到突變(3小時運行時間,30分鐘手動操作時間)

·  簡單的協議 

·  檢測需要少量DNA樣品(1~25 ng)

·  靈敏度高(檢出限<1%)

·  一貫

·  保質期長(> 1年) 

·  兼容各種實時PCR機(ABI-7500,ABI-7900HT,Biorad CFX-96/384,Roche Lightcycler,Qiagen RGQ等) 

·  用于簡單數據解釋的分析軟件

我們還提供專門的技術支持來設置和分析數據。

 

 

 

EGFR突變細節

表皮生長因子受體(EGFR)是受體酪氨酸激酶的家族成員,在表皮細胞的表面上表達。EGFR的過度表達或過度活化與許多癌癥有關,包括肺癌,肛門癌和多形性膠質母細胞瘤。

PNAClamp EGFR突變檢測試劑盒檢測迄今為止EGFR基因中描述的普遍的突變,包括T790M,其存在與酪氨酸激酶抑制劑的抗性相關。檢測EGFR基因中的體細胞突變可以提供預測酪氨酸激酶抑制劑響應的有用策略,以提高接受靶向治療的肺癌患者的存活率。

<PNAClamp EGFR Kit檢測到的突變>

外顯子

氨基酸改變

基數變化

18

Gly719Ala

2156 G> C.

Gly719Ser

2155 G> A.

Gly719Cys

2155 G> T.

19

Glu746_Ala750del

2235_2249 del 15

Glu746_Thr751delinslle

2235_2252 AAT(復雜)

Glu746_Ser752del

2236_2253 del 18

Glu746_Thr751delinsAla

2237_2251 del 15

E746_S752>一個

2237_2254 del 18

Glu746_Ser752delinsVal

2237_2255> T(復雜)

Glu746_Ala750del

2236_2250 del 15

Glu746_Ser752delinsAsp

2238_2255 del 18

L747_A750>點

2238_2248> GC(復雜)

Leu747_Thr751delinsGln

2238_2252> GCA(復雜)

Leu747_Glu749del

2239_2247 del 9

Leu747_Thr751del

2239_2253 del 15

Leu747_Ser752del

2239_2256 del 18

Leu747_Glu749del:Ala750Pro

2239_2248 TTAAGAGAAG> C.

Leu747_Pro753delinsGln

2239_2258> CA(復雜)

Leu747_Thr751delinsSer

2240_2251 del 12

Leu747_Pro753delinsSer

2240_2257 del 18

Leu747_Thr751del

2240_2254 del 15

Leu747_Thr751deinsPro

2239_2251> C(復雜)

20

Thr790Met

2369 C> T.

Ser768lle

2303 G> T.

Ala767_Val769dupAlaSerVal

2307_2308 ins9

His773dupHis

2319_2320 insCAC

Asp770_A771insGly

2310_2311 insGGT

21

leu858Arg

2573 T> G.

leu861Gln

2582 T> A.

KRAS變異細節

KRAS突變存在于幾種癌癥中,包括結腸直腸癌,肺癌,甲狀腺癌和胰腺癌以及膽管癌。KRAS突變通常位于外顯子2的密碼子12和13內,這可能導致p21-ras蛋白的異常生長信號傳導。細胞生長和分裂的這些改變可能引發癌癥發展,因為信號過度。

KRAS突變通常作為藥物反應的有用預后標志物。例如,KRAS突變被認為是對酪氨酸激酶抑制劑如吉非替尼(易瑞沙)或厄洛替尼(特羅謝)的反應的強預后標志物。近,在許多結腸直腸癌患者中檢測到KRAS突變,并且可能與用于結腸癌治療的西妥昔單抗(Erbitux)或帕尼單抗(Vectibix)的應答相關。

<PNAClamp KRAS Kit檢測到的突變>

密碼子

突變

基數變化

Codon12

Gly12Asp

35G>甲

Gly12Ala

35G>Ç

Gly12Val

35G>?

Gly12Ser

34G>甲

Gly12Arg

34G>Ç

Gly12Cys

34G>?

Codon13

Gly13Ser

34G>?

Gly13Arg

37G>Ç

Gly13Cys

37G>?

Gly13Asp

38G>甲

Gly13Ala

38G>Ç

Gly13Val

38G>?

 

 

 

Codon59

Ala59Ser

175G>?

Ala59Thr

175GA

Ala59Glu

176C>甲

Ala59Gly

176C“G

Ala59del

176_178 del CAG

 

 

 

Codon61

Gly60Asp

179克>甲

Gly60Ala

179克>Ç

Gly60Val

179克>?

Gly60Gly

180T>甲

Gly60Gly

180T>Ç

Gln61Glu

181C“G

Gln61Lys

181C>甲

Gln61Leu

182A>?

Gln61Arg

182A“G

Gln61Pro

182A>Ç

Gln61His

183A>?

Gln61His

183A>Ç

 

 

 

密碼子117

Lys117Glu

349A“G

Lys117Arg

350A“G

Lys117Asn

351A>Ç

Lys117Asn

351A>?

 

 

 

密碼子146

Ala146Pro

436G>Ç

Ala146Thr

436G>甲

Ala146Gly

437C“G

Ala146Val

437C>?

Ala146Ala

438A“G

Ala146Ala

438A>Ç

Ala146Ala

438A>?

NRAS突變細節

NRAS突變發現于幾種癌癥,如黑色素瘤(13~25%),結直腸癌(1~6%),肺癌(1%),甲狀腺癌(7%)和肝細胞癌(10%)。據了解,如果患者患有NRAS突變,對于結腸直腸癌藥物如Erbitux和西妥昔單抗的藥物反應降低,轉移性結直腸癌患者的預后很差。

NRAS突變細節

 ·PNAC-1101(43個突變)

沒有。

試劑

密碼子

氨基酸變化

核苷酸變化

宇宙號

1

N_G12 PNA 
混合

2

p.G12S

c.34G>甲

563

p.G12R

c.34G>Ç

561

p.G12C

c.34G>?

562

p.G12N

c.34_35GG> AA

12723

p.G12P

c.34_35GG> CC

559

p.G12Y

c.34_35GG> TA

560

p.G12D

c.35G>甲

564

p.G12A

c.35G>Ç

565

p.G12V

c.35G>?

566

2

N_G13 PNA 
混合

p.G13S

c.37G>甲

571

p.G13R

c.37G>Ç

569

p.G13C

c.37G>?

570

p.G13N

c.37_38GG> AA

24668

p.G13Y

c.37_38GG> TA

568

p.G13D

c.38G>甲

573

p.G13A

c.38G>Ç

575

p.G13V

c.38G>?

574

p.G13V

c.38_39GT> TC

572

p.G13G

c.39T>Ç

576

3

N_A59 PNA 
混合

3

p.A59T

c.175G>甲

578

p.A59D

c.176C>甲

253327

p.A59G

c.176C“G

1178067

4

N_Q61 PNA 
混合

p.Q61K

c.181C>甲

580

p.Q61E

c.181C“G

581

p.Q61R

c.181_182CA> AG

579

p.Q61L

c.181_182CA> TT

12725

p.Q61P

c.182A>Ç

582

p.Q61R

c.182A“G

584

p.Q61L

c.182A>?

583

p.Q61R

c.182_183AA> GG

33693

p.Q61L

c.182_183AA> TG

30646

p.Q61H

c.183A>Ç

586

p.Q61Q

c.183A“G

587

p.Q61H

c.183A>?

585

N_K117 PNA 
混合

4

p.K117E

c.349A“G

-

p.K117R

c.350A“G

-

p.K117N_T

c.351G>?

-

p.K117N_C

c.351G> C ^

-

6

N_A146 PNA 
混合

p.A146T

c.436G>甲

27174

p.A146P

c.436G> C ^

-

p.A146S

c.436G>?

-

p.A146V

c.437C>?

-

p.A146G

c.437C“G

-

 

BRAF突變檢測試劑盒

在幾種癌癥中發現B-raf突變,包括甲狀腺癌,惡性黑素瘤,卵巢癌,結腸直腸癌。

在甲狀腺癌病例中,有超過40種不同類型的B-raf突變。在這些突變中,外顯子15上的V600E突變(在1799堿基中從T變為A)是重要的,超過90%的頻率。特別是,乳頭狀甲狀腺癌中檢測到B-raf V600E突變的頻率約為45%,被認為是甲狀腺癌的預后因素。

另外,結腸直腸癌中的B-raf突變被報道為減少對西妥昔單抗(Erbitux)或panitumuab(Vectibix)的藥物反應的預后標志物。這些結果意味著B-raf突變檢測對于結直腸癌和甲狀腺癌的藥物反應的診斷和預后是必需的。

PI3K3CA突變細節

PI3K(磷酸肌醇3-激酶或PI3-激酶)是能夠磷酸化磷脂酰肌醇的肌醇環的3'位羥基的脂質激酶家族。它們參與協調多種細胞功能,包括細胞生長,增殖,分化,運動,存活和細胞內運輸。

近在某些類型的癌細胞中發現了激活p110α亞基(PIK3CA)的PI3K催化結構域中的突變。PIK3CA突變在各種類型的腫瘤中以25%~40%的頻率被發現,包括結腸直腸癌,胃癌,肺癌,腦癌,子宮內膜癌,卵巢癌,乳腺癌。大約80%的點突變主要在外顯子9(假定的螺旋結構域)和外顯子20(假定的激酶結構域)中,而在不同的位置也可以看到其他類型的突變。

<PNAClamp PIK3CA試劑盒檢測到的突變>

管號

試劑

氨基酸變化

基數變化

外顯子

翻譯地區

1

E542

Glu542Lys

1624 G> A.

外顯子9

螺旋形的

Glu542Gly

1624 A> G.

Glu542Val

1624 A> T.

2

E545

Glu545Lys

1633 G> A.

Glu545Gly

1634 A> G.

Glu54sp

1635 G> T.

3

H1047

His1047Tyr

3139 C> T.

外顯子20

激酶

His1047Leu

3140 A> T.

His1047Arg

3140 A> G.

IDH1突變檢測試劑盒

IDH1(異檸檬酸脫氫酶1,IDH1)的突變可以在膠質母細胞瘤和骨髓增生性腫瘤中發現。

IDH1突變的檢測可以是預后的陽性預測因子和膠質母細胞瘤患者的分子標記物。另一方面,據報道,IDH1突變與骨髓增生性腫瘤的預后不良相關。

PNAClamp IDH1突變檢測試劑盒以高靈敏度檢測R132位置的突變。

 

 

目錄號

產品名稱

描述

尺寸

PNAC-1002

PNAClamp KRAS套件(v2)

G12,G13

30次測試

PNAC-1003

PNAClamp KRAS套件(v3)

G12,G13,Q61

25次測試

PNAC-1004

PNAClamp KRAS套件(加)

A59,K117,A146

25次測試

PNAC-1006

PNAClamp KRAS套件(v4)

G12,G13,A59,Q61,K117,A146

25次測試

PNAC-1101

PNAClamp NRAS套件(v4)

G12,G13,A59,Q61,K117,A146

25次測試

PNAC-2001

PNAClamp BRAF套件

BRAF V600突變

50次測試

PNAC-3002

PNAClamp EGFR試劑盒

G619,E19 d??el,T790,S768,E20 in,L858,L861

25次測試

PNAC-4002

PNAClamp PIK3CA套件

E542,E545,H1047

25次測試

PNAC-5001

PNAClamp IDH1套件

R132突變

25次測試

 

 

 

Pnabio 部分產品列表

貨號

品名

規格

品牌

CP01-20

Reconstitutes to 1 mg/ml, 120 pmol (6 uM x 20 ul)

20 ug

pnabio

CP01-50

Reconstitutes to 1 mg/ml, 300 pmol (6 uM x 50 ul)

50 ug

pnabio

CP01-200

Reconstitutes to 1 mg/ml, 1200 pmol (6 uM x 200 ul)

200 ug (50 ug x 4)

pnabio

CP02

Reconstitutes to 5 mg/ml, 1530 pmol (30 uM x 50 ul)

250 ug

pnabio

CP03

Reconstitutes to 5 mg/ml, 6000 pmol (30 uM x 50 ul x 4 tubes)

1 mg (250 ug x 4)

pnabio

CP04-100

Liquid form 1 mg/ml, 600 pmol (6 uM x 20 ul x 5 tubes)

100 ug (20 ug x 5)

pnabio

CP04-500

Liquid form 5 mg/ml, 3000 pmol (30 uM x 20 ul x 5 tubes)

500 ug (100 ug x 5)

pnabio

CN01

Reconstitutes to 1 mg/ml, 300 pmol (6 uM x 50 ul)

50 ug

pnabio

CN02

Reconstitutes to 5 mg/ml,1530 pmol (30 uM x 50 ul)

250 ug

pnabio

CD01

Reconstitutes to 1 mg/ml,  300 pmol (6 uM x 50 ul)

50 ug

pnabio

CD02

Reconstitutes to 5 mg/ml,1530 pmol (30 uM x 50 ul)

250 ug

pnabio

F1001

C-rich telomere probe, FAM labeled

5 nmole

pnabio

F1002

C-rich telomere probe, Cy3 labeled

5 nmole

pnabio

F1003

C-rich telomere probe,  Cy5 labeled

5 nmole

pnabio

F1004

C-rich telomere probe, Alexa Fluor 488 labeled

5 nmole

pnabio

F1005

G-rich telomere probe, FAM labeled

5 nmole

pnabio

F1006

G-rich telomere probe, Cy3 labeled

5 nmole

pnabio

F1007

G-rich telomere probe, Cy5 labeled

5 nmole

pnabio

F1008

G-rich telomere probe, Alexa Fluor 488 labeled

5 nmole

pnabio

F1009

C-rich telomere probe, FITC labeled

5 nmole

pnabio

F1010

G-rich telomere probe, FITC labeled

5 nmole

pnabio

F1013

   C-rich telomere probe,     Alexa Fluor 647 labeled

5 nmole

pnabio

F1014

   G-rich telomere probe,   Alexa Fluor 647 labeled

5 nmole

pnabio

F1020

TelC probe for arthropods, Alexa Fluor 488 labeled

5 nmole

pnabio

F2001

C-rich telomere probe, Biotin labeled

5 nmole

pnabio

F3001

Centromere probe, FAM labeled

5 nmole

pnabio

F3002

Centromere probe, Cy3 labeled

5 nmole

pnabio

F3005

Centromere probe, Cy5 labeled

5 nmole

pnabio

F3004

Centromere probe, Alexa Fluor 488 labeled

5 nmole

pnabio

F3008

Centromere probe, Biotin labeled

5 nmole

pnabio

F3003

Centromere probe, Cy3 labeled

5 nmole

pnabio

F3006

Centromere probe, FAM labeled

5 nmole

pnabio

F5001

CAG repeats, Cy3 labeled

5 nmole

pnabio

G2001-3

A set of 4 PNA oligos against human globin,

3 nmole

pnabio

G2001-10

A set of 4 PNA oligos against human globin

10 nmole

pnabio

MP01-25

ggcaagtgttcttcgga

25 nmole

pnabio

MP01-50

ggcaagtgttcttcgga

50 nmole

pnabio

PP01-25

ggctcaaccctggacag

25 nmole

pnabio

PP01-50

ggctcaaccctggacag

50 nmole

pnabio

RV01

Surrogate reporter vector with GFP for FACS

5 ug

pnabio

RV02

Surrogate reporter vector with GFP and H2KK for MACS

5 ug

pnabio

RV03

Surrogate reporter vector with GFP and Hygromycin-R

5 ug

pnabio

CV01

Cas9 co-transfection vector (CMV promoter)

5 ug

pnabio

CV02

Cas9, Hygromycin R, and GFP expression vector (CMV promoter)

5 ug

pnabio

CV03

Cas9, RFP, puromycin R expression vector (CMV promoter)

5 ug

pnabio

CV11

Cas9 co-expression vector (EF1a promoter)

5 ug

pnabio

CV12

Cas9, Hygromycin R, and GFP expression vector (EF1a promoter)

5 ug

pnabio

CV13

Cas9, RFP, and Puromycin R expression vector (EF1a promoter)

5 ug

pnabio

FMA-1001

Fmoc-A(Bhoc)-aeg-OH

1 g / 2 g

pnabio

FMG-1001

Fmoc-G(Bhoc)-aeg-OH

1 g / 2 g

pnabio

FMC-1001

Fmoc-C(Bhoc)-aeg-OH

1 g / 2 g

pnabio

FMT-1001

Fmoc-T-aeg-OH

1 g / 2 g

pnabio

FMO-1001

Fmoc-AEEA-OH

1 g / 2 g

pnabio

PNAC-1002

PNAClamp KRAS Kit (v2)

30 tests

pnabio

PNAC-1003

PNAClamp KRAS Kit (v3)

25 tests

pnabio

PNAC-1004

PNAClamp KRAS Kit (plus)

25 tests

pnabio

PNAC-1006

PNAClamp KRAS Kit (v4)

25 tests

pnabio

PNAC-1101

PNAClamp NRAS Kit (v4)

25 tests

pnabio

PNAC-2001

PNAClamp BRAF Kit

50 tests

pnabio

PNAC-3002

PNAClamp EGFR Kit

25 tests

pnabio

PNAC-4002

PNAClamp PIK3CA Kit

25 tests

pnabio

PNAC-5001

PNAClamp IDH1 Kit

25 tests

pnabio

 

 

 

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