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arraystar AS-NM-002說明書

 更新時間:2018-08-07 點擊量:1335

 

Arraystar致力于幫助生物醫學科學研究人員了解監管非編碼RNA(ncRNAs),這已成為21世紀生物醫學研究中吸引力和挑戰性的方面之一。這些非編碼RNA類包括lncRNA,環狀RNA,微小RNA,tRNA,tRF,tiRNA,snoRNA等。自2009年成立以來,我們在ncRNA研究領域的創新產品,深入的實驗專業知識和強大的生物信息學支持了數百種高影響力的出版物。多年來,我們的客戶群已擴展到數千個研究機構。 

超越RNA

隨著新型非編碼RNA的發現及其超出蛋白質編碼轉錄本的調控活性,RNA生物學領域的研究意味著超越編碼信使RNA,這是中心法則的重點。揭示新型ncRNA的關鍵作用的追求引起了強烈的科學興趣,具有發現新的疾病調節劑,新的生物標志物和治療靶標的誘人機會。雖然基因表達分析行業仍主要僅涵蓋mRNA,但Arraystar正在邁向新的道路并向前邁進。 

焦點

除了傳統的mRNA表達分析之外,Arraystar的愿景還集中在長和小的非編碼RNA類的轉錄組范圍分析,每個類具有不同的RNA特性和生物活性,需要更專業的方法和生物信息學來分析:

•lncRNAs 
•環狀RNAs 
•tRNAs 
•tRFs和tiRNAs 
•snoRNAs 
•microRNAs及其靶mRNA 
•piRNAs 

 

NuRNA™小RNA生物發生蛋白PCR陣列(H)

NuRNA™ Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array (H)

 

Arraystar NuRNA™人類小RNA生物發生蛋白質PCR Array分析了185種蛋白質編碼基因的表達,這些基因是與小RNA生物發生途徑密切相關的酶和蛋白質因子。該陣列同時分析7種小RNA生物型的生物發生途徑:miRNA,piRNA,siRNA,snoRNA,snRNA,tRNA和tRNA相關片段(tRF)。它是研究小RNA研究中小RNA生物發生,調控和功能/疾病影響的快速,準確和方便的工具。

Product Name

Catalog No

Size

NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array

AS-NM-002-1

384-well (2*192) / plate

NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array (Roche Light Cycler 480)

AS-NM-002-1-R

384-well (2*192) / plate

 

 

益處
•*內容 - 在GO途徑中分類的小RNA生物相關蛋白的綜合選擇。 
•高性能 - 所有引物對和分析均經過高度優化,經過嚴格驗證。
•方便 - 易于使用,可立即運行的標準qPCR板格式,可直接應用樣品。不需要樣品預擴增。
•完整的Arraystar廣泛的小RNA分析技術選擇,從小RNA測序,qPCR面板到LC-MS / MS的修改檢測。

我們建議 在運行NuRNA™小RNA生物發生PCR陣列時使用我們的  rtStar™First-Strand cDNA合成試劑盒  (AS-FS-001)  和  ArraystarSYBR®GreenReal-time qPCR Master Mix,以獲得*性能。

產品設計背景

小RNA是長度<200nt的非編碼RNA分子。真核小RNA根據其分子特征和基本生物學功能分為生物型:microRNAs(miRNA),PIWI相互作用RNAs(piRNA),短干擾RNAs(siRNA),小核仁RNAs(snoRNA),小核RNAs(snRNA) ,轉移RNA(tRNA)和tRNA相關的片段和一半(tRF)(圖1)。一些類型的小RNA執行基本功能,例如蛋白質翻譯中的tRNA和rRNA修飾中的snoRNA。其他一些被認為是小調節RNA,它通過多種機制調節基因表達和調節生物活性,如mRNA穩定性和翻譯控制,或針對特定基因組區域的表觀遺傳修飾[1-3]。他們的穩定,

小RNA生物發生途徑是產生這些小RNA的潛在過程,并且響應于細胞條件而被調節。通路障礙通常與疾病有關。例如,DROSHA和DICER1(miRNA生物發生中的關鍵蛋白因子)的表達水平隨腫瘤進展的階段而變化,已被研究作為神經母細胞瘤預后的潛在生物標志物[4]。分析小RNAs生物發生途徑有助于研究小RNA,生物學影響和相關疾病。

PCR Arrays是分析聚焦基因組表達的zui可靠工具。為了快速方便地對小RNA生物發生中涉及的蛋白質和酶組分進行表達譜分析,Arraystar開發了個商業小RNA生物發生PCR板。Arraystar NuRNA™人類小RNA生物發生蛋白質PCR Array分析185種蛋白質編碼mRNA基因在小RNA生物發生基因本體論(GO)途徑中的表達。包括Spike-in,陽性PCR,基因組DNA和標準化參考對照以確保zui高的數據質量。

 

圖1.小RNA生物型的生物發生和功能。

參考

[1] Kim VN。小RNA:分類,生物發生和功能。分子和細胞2005; 19:1-15。
[2] Esteller M.人類疾病中的非編碼RNA。自然評論Genetics 2011; 12:861-74。
[3] Matera AG,Terns RM,Terns MP。非編碼RNA:來自小核和小核仁RNA的經驗教訓。自然評論分子細胞生物學2007; 8:209-20。
[4] Lin RJ,Lin YC,Chen J,Kuo HH,Chen YY,Diccianni MB,et al。微克隆特征和Dicer和Drosha的表達可以預測神經母細胞瘤的預后并描繪風險組。癌癥研究2010; 70:7841-50。

 工作流程

 

 

Arraystar 2018年產品列表

 

貨號

品名

規格

品牌

AS-FS-005

rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Kit

12 reactions

arraystar

AS-NR-004-1

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array

384-well/ plate

arraystar

AS-NR-004-1-R

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well/ plate

arraystar

AS-NR-004M-1

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-004M-1-R

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-001-1

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-001-1-R

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-002-1

NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-002-1-R

NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-003-1

NuRNA™ Human Epitranscriptomics PCR Array

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-003-1-R

NuRNA™ Human Epitranscriptomics PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-004-1

NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array

384-well plate

arraystar

AS-NM-004-1-R

NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well plate

arraystar

AS-NR-001H-1

nrStar™ Human tRNA PCR Array V2.0

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001H-1-R

nrStar™ Human tRNA PCR Array V2.0 (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001M-1

nrStar™ Mouse tRNA PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001M-1-R

nrStar™ Mouse tRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001-1

nrStar™ Human tRNA PCR Array V1.0

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-MB-001

Seq-Star™ rRNA Removal Kit

Human/Mouse/Rat NGS RNA-Seq library preparation

arraystar

AS-MB-006-01

Seq-Star™ poly(A) mRNA Isolation Kit

24 reactions

arraystar

AS-MB-006-02

Seq-Star™ poly(A) mRNA Isolation Kit

96 reactions

arraystar

AS-MB-009

Seq-Star™ RNAClean and smallEnrich Beads

10mL

arraystar

AS-MB-009

Seq-Star™ RNAClean and smallEnrich Beads

10mL

arraystar

AS-MB-007

Seq-Star™ DNAClean Beads

50mL

arraystar

AS-MB-008-01

Seq-Star™ DNA Size Selection Kit

24 reactions

arraystar

AS-MB-008-02

Seq-Star™ DNA Size Selection Kit

96 reactions

arraystar

AS-MB-010-01

Seq-Star™ Rapid DNA-seq Kit (Illumina, SetA)

Adapter Barcode(1-12)

arraystar

AS-MB-010-02

Seq-Star™ Rapid DNA-seq Kit (Illumina, SetB)

Adapter Barcode(13-24)

arraystar

AS-MB-012-01

Seq-Star™ Small RNA-seq Kit (Illumina, setA)

Adapter Barcode(1-12)

arraystar

AS-MB-012-02

Seq-Star™ Small RNA-seq Kit (Illumina, setB)

Adapter Barcode(13-24)

arraystar

AS-MB-013-01

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Kit (Illumina, setA)

24 reactions

arraystar

AS-MB-013-02

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Kit (Illumina, setB)

24 reactions

arraystar

AS-PACK-001-A

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Library Prep Package A – Illumina

12 reactions

arraystar

AS-PACK-001-B

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Library Prep Package B – Illumina

12 reactions

arraystar

AS-MR-005-5

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX-), 5mL

5mL

arraystar

AS-MR-005-25

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX-), 25mL

25mL

arraystar

AS-MR-006-5

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX+), 5mL

5mL

arraystar

AS-MR-006-25

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX+), 25mL

25mL

arraystar

AS-FS-001

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit

12 reactions

arraystar

AS-FS-002

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ adaptor)

12 reactions

arraystar

AS-FS-003

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor)

6 reactions

arraystar

AS-FS-003-02

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor)

12 reactions

arraystar

AS-FS-004

rtStar™ tRNA-optimized First-Strand cDNA Synthesis Kit

12 reactions

arraystar

AS-FS-005

rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Kit

12 reactions

arraystar

AS-NR-002-1-M

rtStar™ Pre-designed Human tRF&tiRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-001-1-M

rtStar™ Pre-designed Human tRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-001M-1-M

rtStar™ Pre-designed Mouse tRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-004-1-M

rtStar™ Pre-designed Human Functional LncRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-002-1

nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array

384-well(2*192) / plate

arraystar

AS-NR-002-1-R

nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-002M-1

nrStar™ Mouse tRF PCR Array

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-NR-002M-1-R

nrStar™ Mouse tRF PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-NR-003-1

nrStar™ Human snoRNA PCR Array

384 well / plate

arraystar

AS-NR-003-1-R

nrStar™ Human snoRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 well / plate

arraystar

 

 

 

 

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