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Arraystar AS-NR-004說明書

 更新時間:2018-08-07 點擊量:1089

 

Arraystar致力于幫助生物醫學科學研究人員了解監管非編碼RNA(ncRNAs),這已成為21世紀生物醫學研究中吸引力和挑戰性的方面之一。這些非編碼RNA類包括lncRNA,環狀RNA,微小RNA,tRNA,tRF,tiRNA,snoRNA等。自2009年成立以來,我們在ncRNA研究領域的創新產品,深入的實驗專業知識和強大的生物信息學支持了數百種高影響力的出版物。多年來,我們的客戶群已擴展到數千個研究機構。 

超越RNA

隨著新型非編碼RNA的發現及其超出蛋白質編碼轉錄本的調控活性,RNA生物學領域的研究意味著超越編碼信使RNA,這是中心法則的重點。揭示新型ncRNA的關鍵作用的追求引起了強烈的科學興趣,具有發現新的疾病調節劑,新的生物標志物和治療靶標的誘人機會。雖然基因表達分析行業仍主要僅涵蓋mRNA,但Arraystar正在邁向新的道路并向前邁進。 

焦點

除了傳統的mRNA表達分析之外,Arraystar的愿景還集中在長和小的非編碼RNA類的轉錄組范圍分析,每個類具有不同的RNA特性和生物活性,需要更專業的方法和生物信息學來分析:

•lncRNAs 
•環狀RNAs 
•tRNAs 
•tRFs和tiRNAs 
•snoRNAs 
•microRNAs及其靶mRNA 
•piRNAs 

 

nrStar™ Functional LncRNA PCR Array (H/M)

Product Name

Catalog No

Size

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array

AS-NR-004-1

384-well/ plate

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

AS-NR-004-1-R

384-well/ plate

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array

AS-NR-004M-1

384-well (2*192) / plate

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

AS-NR-004M-1-R

384-well (2*192) / plate

 

nrStar™功能性LncRNA PCR陣列概況372人/ 185小鼠金標準lncRNA具有已知的生物學功能或疾病關聯。它為研究人員提供了一種簡單,準確且數據豐富的交鑰匙解決方案,可用于探索LncRNA功能及其生物標記潛力。

全面收集以生物功能或疾病關聯為特征的*的LncRNA。

•功能和疾病LncRNA經過仔細分類,注釋和交叉引用。

•所有引物組均在多種樣品類型中經過*驗證,以滿足生物標志物發現的需要。

•轉錄物特異性PCR引物能夠明確,準確地檢測每種單獨的LncRNA同種型。

我們建議在運行nrStar™功能性LncRNA PCR陣列時使用我們的rtStar™First-Strand cDNA合成試劑盒  (AS-FS-001)ArraystarSYBR®GreenReal-time qPCR Master Mix,以獲得*性能。

 

•已知功能性lncRNA的*覆蓋范圍:  從的公共數據庫和具有里程碑意義的出版物中全面收集以生物功能或人類疾病關聯為特征的*的LncRNA。 

 

圖1.從Bartonicek等人收集了一些與癌癥相關的lncRNA。2016年 

 

圖2.從Devaux等人收集的一些涉及心臟通路的LncRNA。2015年

•綜合注釋:  與癌癥,心血管疾病和神經退行性疾病等疾病相關的LncRNA經過仔細分類,注釋和交叉引用。


表格1。注釋信息包括:
                  基于基因組位置的類:[增強子,反義,基因間,內含子,雙向...] 
                  靶mRNA基因
                  機制:[信號,誘餌,支架,指導,ceRNA,miRNA海綿,剪接...] 
                  生物功能:[細胞周期,分化,甲基化,免疫,代謝...] 
                  疾病:[癌癥,心血管,神經退行性疾病,腎臟,糖尿病,綜合征...] 

    注釋實施例1-癌癥相關的lncRNA NBAT-1

    
    圖3.由Arraystar注釋的NBAT-1的信息顯示在綠色矩形區域中。

    注釋實施例2 - 心血管疾病中的LncRNA Mhrt

    
    圖4.由Arraystar注釋的MHRT信息顯示在藍色矩形區域中。

    注釋實施例3-LncRNA BACE1-AS在神經變性疾病中的應用

    
     圖5.由Arraystar注釋的BACE1-AS的信息顯示在紅色矩形區域中。

•用于生物標記物篩選和驗證的強大工具:  所有引物組均經過優化,并使用多種樣品類型進行了實驗驗證,以滿足生物標記物發現的需要。

 

圖6. PCR陣列上的lncRNA片段,具有公布的生物標記電位和效用。

•轉錄物特異性檢測:  轉錄物特異性PCR引物設計用于靶向特定外顯子或剪接點位點,以明確和準確地檢測每種單獨的LncRNA同種型。

•zui可靠和準確的定量: 通過使用外部對照(RNA Spike-In和陽性PCR對照),基因組DNA對照和六個內部管家基因,每個lncRNA以高準確度和數據質量進行定量。通過經實驗驗證的算法選擇的多個參考基因的幾何平均值而不是單個參考基因進行標準化。 

•快速簡便: 即用型PCR陣列,采用384孔板格式。整個過程可在不到4小時內完成。

 

 

工作流程:

圖1. nrStar™功能性LncRNA PCR陣列的工作流程

 

兼容的qPCR儀器:

ABI ViiA™7 
ABI 7500和ABI 7500 FAST 
ABI 7900HT 
ABI QuantStudio™6 Flex實時PCR系統
ABI QuantStudio™7 Flex實時PCR系統
ABI QuantStudio™12K Flex實時PCR系統
Bio-Rad CFX384 
Bio-Rad iCycler &iQ實時PCR系統
Eppendorf Realplex 
QIAGEN轉子基因Q 100 
Roche LightCycler 480 
Stratagene Mx3000 
Roche LightCycler 480

 

 

Arraystar 2018年產品列表

 

貨號

品名

規格

品牌

AS-FS-005

rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Kit

12 reactions

arraystar

AS-NR-004-1

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array

384-well/ plate

arraystar

AS-NR-004-1-R

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well/ plate

arraystar

AS-NR-004M-1

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-004M-1-R

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-001-1

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-001-1-R

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-002-1

NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-002-1-R

NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-003-1

NuRNA™ Human Epitranscriptomics PCR Array

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-003-1-R

NuRNA™ Human Epitranscriptomics PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-004-1

NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array

384-well plate

arraystar

AS-NM-004-1-R

NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well plate

arraystar

AS-NR-001H-1

nrStar™ Human tRNA PCR Array V2.0

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001H-1-R

nrStar™ Human tRNA PCR Array V2.0 (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001M-1

nrStar™ Mouse tRNA PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001M-1-R

nrStar™ Mouse tRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001-1

nrStar™ Human tRNA PCR Array V1.0

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-MB-001

Seq-Star™ rRNA Removal Kit

Human/Mouse/Rat NGS RNA-Seq library preparation

arraystar

AS-MB-006-01

Seq-Star™ poly(A) mRNA Isolation Kit

24 reactions

arraystar

AS-MB-006-02

Seq-Star™ poly(A) mRNA Isolation Kit

96 reactions

arraystar

AS-MB-009

Seq-Star™ RNAClean and smallEnrich Beads

10mL

arraystar

AS-MB-009

Seq-Star™ RNAClean and smallEnrich Beads

10mL

arraystar

AS-MB-007

Seq-Star™ DNAClean Beads

50mL

arraystar

AS-MB-008-01

Seq-Star™ DNA Size Selection Kit

24 reactions

arraystar

AS-MB-008-02

Seq-Star™ DNA Size Selection Kit

96 reactions

arraystar

AS-MB-010-01

Seq-Star™ Rapid DNA-seq Kit (Illumina, SetA)

Adapter Barcode(1-12)

arraystar

AS-MB-010-02

Seq-Star™ Rapid DNA-seq Kit (Illumina, SetB)

Adapter Barcode(13-24)

arraystar

AS-MB-012-01

Seq-Star™ Small RNA-seq Kit (Illumina, setA)

Adapter Barcode(1-12)

arraystar

AS-MB-012-02

Seq-Star™ Small RNA-seq Kit (Illumina, setB)

Adapter Barcode(13-24)

arraystar

AS-MB-013-01

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Kit (Illumina, setA)

24 reactions

arraystar

AS-MB-013-02

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Kit (Illumina, setB)

24 reactions

arraystar

AS-PACK-001-A

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Library Prep Package A – Illumina

12 reactions

arraystar

AS-PACK-001-B

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Library Prep Package B – Illumina

12 reactions

arraystar

AS-MR-005-5

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX-), 5mL

5mL

arraystar

AS-MR-005-25

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX-), 25mL

25mL

arraystar

AS-MR-006-5

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX+), 5mL

5mL

arraystar

AS-MR-006-25

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX+), 25mL

25mL

arraystar

AS-FS-001

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit

12 reactions

arraystar

AS-FS-002

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ adaptor)

12 reactions

arraystar

AS-FS-003

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor)

6 reactions

arraystar

AS-FS-003-02

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor)

12 reactions

arraystar

AS-FS-004

rtStar™ tRNA-optimized First-Strand cDNA Synthesis Kit

12 reactions

arraystar

AS-FS-005

rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Kit

12 reactions

arraystar

AS-NR-002-1-M

rtStar™ Pre-designed Human tRF&tiRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-001-1-M

rtStar™ Pre-designed Human tRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-001M-1-M

rtStar™ Pre-designed Mouse tRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-004-1-M

rtStar™ Pre-designed Human Functional LncRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-002-1

nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array

384-well(2*192) / plate

arraystar

AS-NR-002-1-R

nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-002M-1

nrStar™ Mouse tRF PCR Array

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-NR-002M-1-R

nrStar™ Mouse tRF PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-NR-003-1

nrStar™ Human snoRNA PCR Array

384 well / plate

arraystar

AS-NR-003-1-R

nrStar™ Human snoRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 well / plate

arraystar

 

 

 

 

上海起發實驗試劑有限公司是實驗試劑一站式采購服務商

1:強大的進口輻射能力,血清、抗體、耗材、大部分限制進口品等。

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6:我們還是Santa,Advanced Biotechnologies Inc,Athens Research & Technology,bangs,BBInternational,crystalchem,dianova,FD Neurotechnologies,Inc. FormuMax Scientific,Inc, Genebridege, Glycotope Biotechnology GmbH; iduron,Innovative Research of America, Ludger, neuroprobe,omicronbio, Polysciences,prospecbi, QA-BIO,quickzyme,RESEARCH DIETS,INC,sterlitech;sysy,TriLink BioTechnologies,Inc;worthington-biochem,zyagen等幾十家國外公司授權代理。

7:我們還是invitrogen,qiagen,MiraiBioam,sigma;neb,roche,merck, rnd,BD, GE,pierce,BioLegend等*批發,歡迎合作。